Mancheron Alban

Dans les précédents articles [1, 2], nous avions découvert quelques outils d’analyse bioinformatique et procédé à une première analyse d’une région d’intérêt du virus SARS-CoV-2. Nous allons avec ce dernier opus finir d’explorer la structure de cet organisme et illustrer encore une fois l’incidence du modèle linuxien sur les progrès dans les sciences.

Cet article s’adresse principalement à celles et ceux qui auraient une tablette de la marque Wacom à configurer. Pour les autres, c’est l’occasion de lire quelques lignes de Bash et de (re)découvrir quelques commandes comme xbindkeys ou encore notify-send (donc un petit plaisir pour les yeux).

« J'ai lu et accepte les Conditions d'Utilisation » est le pire mensonge du Web. L’équipe de ToS;DR vise à y remédier. Ceci est la phrase d’exergue que l’on trouve sur le site https://tosdr.org/. Voyons ce que cela implique.

Faut-il être un bon algorithmicien pour être un bon programmeur ? Et inversement, faut-il être un bon programmeur pour être un bon algorithmicien ? Ceci n’est pas le sujet de philosophie ou de NSI du bac 2021, mais ce sont les questions auxquelles s’intéresse cet article.

Vous avez certainement entendu parler du changement des conditions d’utilisation de l’application WhatsApp et de la nécessité de se tourner vers une solution alternative. Je vous propose à travers ce faux problème de comprendre d’une part les stratégies techniques et technologiques sur lesquelles s’appuient les différents outils, mais également les modèles économiques sur lesquels ces outils sont basés. À l’issue de cet article, peut-être trouverez-vous l’application qui vous convient.

Dans un précédent article [1], nous avions découvert la suite EMBOSS et mis en évidence des régions d’intérêt de la séquence nucléique de référence du virus SARS-CoV-2. Nous allons donc continuer le chemin en exploitant de nouveaux outils, certains issus de la bioinformatique et d’autres issus de la communauté linuxienne.

Nul n’est besoin de convaincre que les systèmes GNU/Linux sont un atout majeur dans l’évolution des connaissances de nombreuses disciplines. C’est particulièrement le cas dans l’étude et la compréhension du vivant, qui a permis l’essor ces dernières décennies de cette « trans-discipline » qu’est la bioinformatique. Voyons à travers cette série de 3 articles comment les outils existants pour notre OS favori permettent d’appréhender la découverte d’un nouvel organisme.

L’outil make permet de fabriquer des fichiers selon des règles de production décrites dans une syntaxe très simple. Dans cet article, nous allons explorer les grands principes de l’écriture de ces règles et pour ceux qui ne sont pas encore familiers de cet outil, vous faire regretter d’avoir attendu si longtemps pour le connaître…

Pouvoir conserver un historique dédié pour chaque projet, voici l’idée géniale énoncée par Tristan Colombo dans un précédent article de GLMF [1]. Cet article reprend ce concept génial (je l’ai déjà dit?) et l’étoffe en simplifiant son installation et en ajoutant quelques fonctionnalités (comme l’autodétection de projets versionnés pour proposer à l’utilisateur d’activer un historique dédié, si ce n’est pas le cas).