Voyage initiatique vers la bioinformatique : en route pour l’aventure

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
253
Mois de parution
novembre 2021
Spécialité(s)


Résumé

Dans un précédent article [1], nous avions découvert la suite EMBOSS et mis en évidence des régions d’intérêt de la séquence nucléique de référence du virus SARS-CoV-2. Nous allons donc continuer le chemin en exploitant de nouveaux outils, certains issus de la bioinformatique et d’autres issus de la communauté linuxienne.


Où en étions-nous ? Ah oui, je me souviens…

Nous avions récupéré quelques séquences de SARS-CoV-2, dont la séquence de référence du virus (NC_045512.2). Nous avions également installé et pris en main la suite EMBOSS [2,3], ce qui nous avait permis de commencer l’analyse des séquences récupérées. Nous avions notamment mis en évidence des régions de la séquence de référence, appelées ORF (Open Reading Frames – cadres ouverts de lecture), qui correspondent à de potentielles protéines que le virus ferait produire par l’organisme hôte (celui qu’il squatte sans vergogne) et qui lui permettent de se reproduire. Ah oui, j’avais oublié. La biologie est ici présentée sous un angle assez imagé et peut parfois piquer les yeux des puristes (donc, si vous avez dans votre entourage des biologistes, n’essayez pas de frimer en reprenant mes propos, cela pourrait tourner à votre désavantage). Par exemple, vous pouvez tout à fait vous représenter un...

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Voyage initiatique vers la bioinformatique : les premiers pas

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
251
Mois de parution
septembre 2021
Spécialité(s)
Résumé

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Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
247
Mois de parution
avril 2021
Spécialité(s)
Résumé

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Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
241
Mois de parution
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Spécialité(s)
Résumé

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Spécialité(s)
Résumé

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11 article(s) - ajoutée le 01/07/2020
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10 article(s) - ajoutée le 01/07/2020
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