Mancheron Alban

Mancheron Alban

Enseignant-chercheur en bioinformatique - Université de Montpellier

13 article(s)
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Description

Titulaire d'un Doctorat en Informatique de l'Université de Nantes, Alban Mancheron a ensuite travaillé successivement à l'Université des Antilles et de la Guyane (DSI de Schœlcher en Martinique), à l'INRIA (centre de Lille), au CNRS (Montpellier). Il est en poste à la Faculté des Sciences de l'Université de Montpellier depuis 2011 (équipe MAB du LIRMM).

Ses enseignements sont répartis entre l'informatique et la bioinformatique et sa recherche porte principalement sur l'indexation et la comparaison in silico de séquences biologiques.

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Enseignant-chercheur en bioinformatique - Université de Montpellier
Articles de l'auteur

Nginx a 20 ans : un tour d’horizon

Magazine
Marque
Linux Pratique
Numéro
148
Mois de parution
mars 2025
Spécialité(s)
Résumé

Je me souviens encore de la sortie de Nginx, juste après avoir passé plusieurs jours à configurer un serveur Apache. Je m’étais dit à cette époque (que les moins de 20 ans ne peuvent donc pas connaître) que malgré une consommation de ressources annoncée bien plus faible et la syntaxe plus lisible annoncée par ce nouvel outil, il était probablement moins fiable et que si Nginx tenait sur la durée, je lui donnerais sa chance… Il y a quelques années, j’ai donc tenu mon engagement. Aujourd’hui, il me paraît opportun de célébrer cet anniversaire dans les pages de notre magazine préféré.

Nginx a 20 ans : configuration avancée

Magazine
Marque
Linux Pratique
Numéro
148
Mois de parution
mars 2025
Spécialité(s)
Résumé

Dans l’article précédent, nous avions vu les principes généraux de configuration de Nginx [1], je vous avais promis de montrer comment réaliser un modèle de configuration permettant de déployer des services très facilement. C’est ce que je vous propose de voir dans les pages qui suivent.

Voyage initiatique vers la bioinformatique : la récompense est au bout du chemin

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
257
Mois de parution
mai 2022
Spécialité(s)
Résumé

Dans les précédents articles [1, 2], nous avions découvert quelques outils d’analyse bioinformatique et procédé à une première analyse d’une région d’intérêt du virus SARS-CoV-2. Nous allons avec ce dernier opus finir d’explorer la structure de cet organisme et illustrer encore une fois l’incidence du modèle linuxien sur les progrès dans les sciences.

Scripting Shell : configurer sa tablette Wacom en quelques heures

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
HS n°
Numéro
119
Mois de parution
avril 2022
Spécialité(s)
Résumé

Cet article s’adresse principalement à celles et ceux qui auraient une tablette de la marque Wacom à configurer. Pour les autres, c’est l’occasion de lire quelques lignes de Bash et de (re)découvrir quelques commandes comme xbindkeys ou encore notify-send (donc un petit plaisir pour les yeux).

¡ Viva la libertad !

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
254
Mois de parution
décembre 2021
Spécialité(s)
Résumé

Vous avez certainement entendu parler du changement des conditions d’utilisation de l’application WhatsApp et de la nécessité de se tourner vers une solution alternative. Je vous propose à travers ce faux problème de comprendre d’une part les stratégies techniques et technologiques sur lesquelles s’appuient les différents outils, mais également les modèles économiques sur lesquels ces outils sont basés. À l’issue de cet article, peut-être trouverez-vous l’application qui vous convient.

Voyage initiatique vers la bioinformatique : en route pour l’aventure

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
253
Mois de parution
novembre 2021
Spécialité(s)
Résumé

Dans un précédent article [1], nous avions découvert la suite EMBOSS et mis en évidence des régions d’intérêt de la séquence nucléique de référence du virus SARS-CoV-2. Nous allons donc continuer le chemin en exploitant de nouveaux outils, certains issus de la bioinformatique et d’autres issus de la communauté linuxienne.

Voyage initiatique vers la bioinformatique : les premiers pas

Magazine
Marque
GNU/Linux Magazine
Numéro
251
Mois de parution
septembre 2021
Spécialité(s)
Résumé

Nul n’est besoin de convaincre que les systèmes GNU/Linux sont un atout majeur dans l’évolution des connaissances de nombreuses disciplines. C’est particulièrement le cas dans l’étude et la compréhension du vivant, qui a permis l’essor ces dernières décennies de cette « trans-discipline » qu’est la bioinformatique. Voyons à travers cette série de 3 articles comment les outils existants pour notre OS favori permettent d’appréhender la découverte d’un nouvel organisme.